おかざきPの記録

Mac, QNAPの設定やプロデューサー業の記録

自動化

ImageJとpythonで粒子解析を自動化する

追記(2022/06/26) やったこと 改変したpythonコード 追記(2022/06/26) 自動化の難易度が高い画像を手動で分析する方法も投稿しました. やったこと ImageJを用いて粒子形状を自動で解析する初歩的な内容はこちらの方がまとめられている. ただ個人的には改善…

ImageJ Fijiとpythonでフォルダ内の画像を一括処理

ImageJを使う理由 この記事で説明する内容 pythonのコード コードの書き方 画像の開きと保存(と閉じ) 画像の切り取り フォルダ内の画像を一括処理 GUIでフォルダを選択する フォルダをコマンドライン引数で受け付ける(headlessモード) 所感 ImageJを使う…